Qu'est ce que le microbiote ?
- Virginie Gloor
- 29 nov. 2022
- 3 min de lecture
Dernière mise à jour : 6 déc. 2022
Le microbiote était autrefois appelé la "Flore intestinale" mais lorsque l'on a découvert qu'il était composé de microbes, comme des bactéries, des champignons et même quelques virus, cette flore a été rebaptisée.
Le microbiote est donc l'ensemble de ces microorganismes et pour le nommer, on fera référence à sa bio-géographie spécifique.
En effet, notre microbiote réside aussi dans le tractus respiratoire mais aussi dans le vagin.

Mais ici il est question de nutrition, aussi nous nous concentrerons sur le microbiote intestinal.
Parfois on entend le terme "microbiome" ? Est ce la même chose ?
Le microbiome fait référence au génome du microbiote, donc des microbes qui le composent, l'expression de leur génome ainsi que les conditions "écologiques de ces milieux.
Le microbiote est individuel et certaines études ont même montré que de vrais jumeaux ayant le même capital génétique, peuvent avoir un microbiote différent.
Même si, au moment de la naissance, ceux-ci reçoivent le microbiote des parents (principalement de la mère au moment d'une naissance par voie naturelle) , il a été démontré qu'avec l'alimentation et l'âge, on pouvait observer une diversification.
Certains facteurs peuvent influencer le microbiome comme
la température
le pH
les différentes hormones produites par le corps
les graisses/protéines/fibres apportées par la nutrition
l'exposition aux UV (qui permet la production de la vitamine D)
l'état des muqueuses du système digestif.
Quelques chiffres interessants
Le microbiote comporte plus de bactéries que le corps comporte de cellules humaines. Autant dire que nous devons le chouchouter car il est notre allié santé !
Jusqu'à 2 kg de notre poids total provient des bactéries qui vivent dans notre organisme.
Le microbiote intestinal, ses interactions avec notre deuxième cerveau (l'intestin) et l'axe Intestin-Cerveau
Il faut savoir que notre intestin comporte aussi des neurones qui interagissent via plus de 30 neurotransmetteurs différents avec notre cerveau et c'est une des raisons pour laquelle il est parfois appelé notre "deuxième cerveau"
Notre microbiote cohabite donc avec les cellules humaines de notre "deuxième cerveau"et un individu "héberge" environ 200 espèces différentes de microbes (sur les 300 espèces recensées).
Ces microbes ont une fonction importante dans la digestion, la fabrication de la vitamine K et ont une influence sur certaines substances comme les neurotransmetteurs ou sur notre sytème immunitaire. Ils produisent aussi certaines substances qui se retrouvent dans notre circulation sanguine et peuvent être ensuite acheminée dans différents organes de notre corps.

Le système digestif, de part son reseau neuronal et sanguin, communique avec le système nerveux central.
On parle de l'axe Intestin-Cerveau
(En anglais : Gut-Brain Axis)
Il reçoit et envoie des messages par la voie nerveuse et la voie sanguine:
La voie nerveuse est très rapide - de l'ordre de la seconde! Les informations sont transmises principalement par le nerf vague qui relie l'ensemble des viscères au système nerveux central. Qui n'a jamais ressenti une contraction abdominale subite provoquée par une émotion forte ? ;-)
La voie sanguine - moins rapide - de l'ordre de la minute ! Avec le transport des nutriments ou d'hormones par ex.
Pour plus d'information sur cet axe "intestin-Cerveau" vous pouvez consulter l'article très détaillé de la fondation Microbiome en cliquant sur ce lien.
Qu'est ce que la dysbiose ?
Nous entendons parler de bons ou de mauvais microbes dans notre microbiote et notre bonne santé résulte d'un bon équilibre.
Voici les bactéries les plus connues et leur classement dans l'infographie ci-dessous:

Quand cet équilibre n'est plus garanti il peut arriver que la proportion de "mauvaises" bactéries entraines une dysbiose, avec des effets nefastes, comme les inflammations intestinale, des infections, des ulcères ou certaines maladies auto-immunes.
Certains facteurs peuvent influencer négativement le microbiote et donc mener à une dysbiose comme :
une alimentation non équilibrée : aliments trop sucrés, trop gras ou pas assez de fibre
la prise de médicaments (ex. les antibiotiques)
le tabac (risque d’inflammation intestinale)
ou le stress.
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